Después de rescatar la Última Orden y de recibir un balazo en la cabeza, los mejores expertos de Academy City descansan en el hospital. Pero la recuperación de Accelerator se interrumpe cuando una misteriosa niña que lleva una foto de su pequeño compañero clon pide ayuda. Ahora se enfrentan a la Acción Disciplinaria, una coalición contra el mal cuyos siniestros planes amenazan a Last Order, Academy City e incluso al mundo entero.